Национальная палата предпринимателей Казахстана «Атамекен» совместно с государственными органами и представителями фармацевтического бизнеса рассмотрела проблемы работы информационной системы Keden при таможенном оформлении лекарственных средств, медицинских изделий, сырья и оборудования. Основные вопросы касались расхождений в системных настройках, требований к подтверждающим документам и применения льгот по налогу на добавленную стоимость (НДС).

Рабочая видеоконференция состоялась 14 октября 2026 года. В ней приняли участие представители Комитета государственных доходов Министерства финансов РК, Комитета медицинского и фармацевтического контроля Министерства здравоохранения РК, фармацевтических компаний и отраслевых объединений.

Участники обсудили применение льгот по НДС, предусмотренных постановлениями Правительства Казахстана № 1203 и № 1204 от 31 декабря 2025 года. По словам представителей бизнеса, действующие настройки форматно-логического контроля и данные справочников Keden не всегда соответствуют требованиям нормативных правовых актов. В результате при таможенном оформлении у предпринимателей могут запрашивать дополнительные документы, необходимость предоставления которых для получения налоговой льготы вызывает вопросы. Среди них – регистрационные удостоверения, разрешения на ввоз, лицензии на фармацевтическую деятельность или производство, договоры поставки в рамках гарантированного объёма бесплатной медицинской помощи (ГОБМП) и обязательного социального медицинского страхования (ОСМС), а также обязательства о целевом использовании продукции.

Отдельное внимание уделили орфанным и социально значимым лекарственным средствам. Участники отметили необходимость согласовать подходы к подтверждению категории препаратов, применению соответствующих перечней и определению случаев, когда для получения льготы требуется договор поставки в рамках ГОБМП и ОСМС.

Также рассмотрели ситуацию с ввозом продукции in bulk по коду ТН ВЭД 3004 90 000 8. Несмотря на включение товара в соответствующий перечень, система не распознала основание для применения льготы. Чтобы не допустить остановки производства, компания была вынуждена уплатить НДС.

По итогам обсуждения участники договорились проверить актуальность десятизначных кодов ТН ВЭД и сведений, содержащихся в справочниках информационной системы.

«Наша задача – сделать так, чтобы импорт и таможенное оформление проходили с меньшим количеством затруднений, а налоговые льготы применялись правомерно и предсказуемо», – отметила модератор встречи, управляющий директор – директор Департамента таможенного администрирования НПП «Атамекен» Дина Мамашева.

По итогам встречи определены три основных направления дальнейшей работы:

·         техническая настройка системы с учётом требований постановлений № 1203 и № 1204;

·         подготовка единых методологических разъяснений о составе документов и условиях применения льгот для различных категорий товаров;

·         актуализация справочников и классификаторов, включая проверку кодов ТН ВЭД и корректности системных проверок.

Кроме того, предстоит согласовать подходы к учёту сроков действия договоров, объёмов ввоза и последующей реализации товаров, а также проработать спорные позиции совместно с профильными подразделениями государственных органов.

«Атамекен» продолжит собирать обращения предпринимателей, сталкивающихся с некорректной работой Keden или запросами дополнительных документов при таможенном оформлении. Для ускорения рассмотрения таких случаев компаниям рекомендуют указывать номер декларации, код ТН ВЭД, основание применения льготы, перечень запрошенных документов и наименование таможенного органа.

Систематизированные обращения будут направлять в Комитет государственных доходов Министерства финансов РК и, при необходимости, в Комитет медицинского и фармацевтического контроля Министерства здравоохранения РК. Государственным органам предложено проверить соответствие алгоритмов системы действующим нормативным требованиям и подготовить единые разъяснения по документам, необходимым для применения льгот.

Обращения по вопросам некорректной работы Keden участники внешнеэкономической деятельности могут направлять в НПП «Атамекен» через систему «е-Otinish».

Что такое Keden

Keden – информационная система таможенного оформления Казахстана, предназначенная для цифровизации таможенных процедур. Она используется, в частности, для электронного декларирования товаров и взаимодействия участников внешнеэкономической деятельности с таможенными органами.

Официальный портал системы: keden.kgd.gov.kz.